Protein–RNA interactions for Protein: P00395

MT-CO1, Cytochrome c oxidase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO1P00395 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MT-CO1P00395 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MT-CO1P00395 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MT-CO1P00395 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms