Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIOO75962 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIOO75962 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIOO75962 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIOO75962 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
TRIOO75962 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIOO75962 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIOO75962 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIOO75962 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIOO75962 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIOO75962 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIOO75962 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIOO75962 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIOO75962 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIOO75962 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIOO75962 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIOO75962 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIOO75962 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIOO75962 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIOO75962 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIOO75962 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIOO75962 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIOO75962 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIOO75962 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIOO75962 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIOO75962 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms