Protein–RNA interactions for Protein: O75610

LEFTY1, Left-right determination factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEFTY1O75610 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LEFTY1O75610 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LEFTY1O75610 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LEFTY1O75610 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms