Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MAGEC1O60732 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAGEC1O60732 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAGEC1O60732 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms