Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCM3APO60318 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MCM3APO60318 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCM3APO60318 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms