Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DUX1O43812 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DUX1O43812 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DUX1O43812 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX1O43812 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX1O43812 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX1O43812 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DUX1O43812 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DUX1O43812 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DUX1O43812 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DUX1O43812 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DUX1O43812 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX1O43812 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX1O43812 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX1O43812 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX1O43812 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DUX1O43812 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUX1O43812 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DUX1O43812 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms