Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA1GO43497 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACNA1GO43497 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACNA1GO43497 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
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