Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCP110O43303 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCP110O43303 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCP110O43303 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCP110O43303 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCP110O43303 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCP110O43303 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCP110O43303 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCP110O43303 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCP110O43303 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCP110O43303 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCP110O43303 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCP110O43303 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCP110O43303 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCP110O43303 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCP110O43303 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCP110O43303 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCP110O43303 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCP110O43303 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCP110O43303 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCP110O43303 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCP110O43303 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCP110O43303 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCP110O43303 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCP110O43303 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCP110O43303 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCP110O43303 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCP110O43303 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCP110O43303 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCP110O43303 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms