Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC3O15379 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDAC3O15379 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms