Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H7C0S8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H7C0S8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C0S8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C0S8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
H7C0S8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
H7C0S8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H7C0S8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H7C0S8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H7C0S8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H7C0S8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H7C0S8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H7C0S8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H7C0S8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H7C0S8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H7C0S8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms