Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HACD1B0YJ81 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HACD1B0YJ81 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HACD1B0YJ81 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms