Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SH2D7A6NKC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH2D7A6NKC9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms