Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRN3P2A6NIE6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3P2A6NIE6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3P2A6NIE6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms