Protein–RNA interactions for Protein: A6NF83

NUPR2, Nuclear protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR2A6NF83 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NUPR2A6NF83 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUPR2A6NF83 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms