Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf170A2RU37 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf170A2RU37 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms