Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
U3KQE9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
U3KQE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
U3KQE9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
U3KQE9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
U3KQE9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
U3KQE9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
U3KQE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
U3KQE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
U3KQE9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
U3KQE9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
U3KQE9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
U3KQE9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
U3KQE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
U3KQE9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms