Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGB2Q9Y5G2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHGB2Q9Y5G2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHGB2Q9Y5G2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms