Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB15Q9Y5E8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB15Q9Y5E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PCDHB15Q9Y5E8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB15Q9Y5E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB15Q9Y5E8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms