Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NDUFAF1Q9Y375 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NDUFAF1Q9Y375 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms