Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SACSQ9NZJ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SACSQ9NZJ4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms