Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DNAH9Q9NYC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DNAH9Q9NYC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DNAH9Q9NYC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms