Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM100Q9NV29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TMEM100Q9NV29 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM100Q9NV29 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms