Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SMC4Q9NTJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMC4Q9NTJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms