Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
THSD1Q9NS62 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
THSD1Q9NS62 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THSD1Q9NS62 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms