Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BATF3Q9NR55 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BATF3Q9NR55 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms