Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SARS2Q9NP81 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SARS2Q9NP81 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SARS2Q9NP81 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms