Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOBEC3GQ9HC16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APOBEC3GQ9HC16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOBEC3GQ9HC16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms