Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NTN4Q9HB63 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NTN4Q9HB63 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms