Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSS3Q9H6R3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS3Q9H6R3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS3Q9H6R3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms