Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HIPK3Q9H422 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HIPK3Q9H422 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HIPK3Q9H422 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms