Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDCBP2Q9H190 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDCBP2Q9H190 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms