Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHACTR1Q9C0D0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms