Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NPCDR1Q9BY65 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NPCDR1Q9BY65 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms