Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BBS2Q9BXC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BBS2Q9BXC9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BBS2Q9BXC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms