Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMAD5Q99717 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMAD5Q99717 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms