Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EIF3CQ99613 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EIF3CQ99613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms