Protein–RNA interactions for Protein: Q99470

SDF2, Stromal cell-derived factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF2Q99470 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF2Q99470 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF2Q99470 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF2Q99470 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDF2Q99470 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDF2Q99470 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDF2Q99470 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SDF2Q99470 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDF2Q99470 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SDF2Q99470 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDF2Q99470 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms