Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNGAP1Q96PV0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNGAP1Q96PV0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNGAP1Q96PV0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms