Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SORCS2Q96PQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SORCS2Q96PQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms