Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNBD2Q96M20 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms