Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC136Q96JN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC136Q96JN2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC136Q96JN2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms