Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf43Q96C57 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C12orf43Q96C57 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C12orf43Q96C57 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2273.3 ms