Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NKD1Q969G9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKD1Q969G9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKD1Q969G9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms