Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC38A9Q8NBW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC38A9Q8NBW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC38A9Q8NBW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.5 ms