Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECAB1Q8N987 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NECAB1Q8N987 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NECAB1Q8N987 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms