Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HACE1Q8IYU2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HACE1Q8IYU2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HACE1Q8IYU2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms