Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPAS3Q8IXF0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPAS3Q8IXF0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms