Protein–RNA interactions for Protein: Q86UV7

TRIM73, Tripartite motif-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM73Q86UV7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM73Q86UV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM73Q86UV7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM73Q86UV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms