Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01551Q86U37 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01551Q86U37 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms