Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
WDR53Q7Z5U6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
WDR53Q7Z5U6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms